ระบบ MU Vote ออกแบบมาให้ “โปร่งใส” ในหลายมิติ แต่ก็ยังคงรักษาความลับของผู้โหวต เพื่อให้กระบวนการเลือกตั้งเป็นธรรม ตรวจสอบได้ ซึ่งมีการปกปิดข้อมูลผู้โหวต โดยระบบ MU Vote แยกข้อมูล “ตัวตน” กับ “คะแนนที่เลือก” ออกจากกัน แม้แต่ผู้ดูแลระบบไม่สามารถรู้ได้ว่าใครเลือกให้ใคร และมีการเข้ารหัสข้อมูลเพื่อป้องกันการเข้าถึงโดยไม่ได้รับอนุญาต ดังนั้นผู้มีสิทธิ์ลงคะแนนสามารถใช้สิทธิ์ได้เพียง 1 ครั้งเท่านั้น
